Pada 2016, dua Rafale M dalam standar terbaru “F3″ (M42 dan M43) disampaikan Dassault Aviation ke Angkatan Laut Perancis di pangkalan d’Aéronautique Navale” Landivisiau di Brittany . M42 ditugaskan untuk Flottile (Fighter Squadron) 12F sedangkan M43 akan segera bergabung Flottile 11F.
Pada 2017, Angkatan Laut Perancis mengharapkan untuk menerima yang terakhir dari sepuluh Rafale M “F1” upgrade ke “F3” serta tiga pesawat baru. Pada akhirnya nanti sebanak 42 jet tempur Rafale M “F3” akan digunakan oleh Angkatan Laut Perancis. Pada bulan Oktober 2014, Angkatan Laut Perancis menerima penyerahan pertama Rafale M ditingkatkan ke standar F3.